workflow_generator

Gera modelos de scripts bash para fluxos de trabalho comuns do deepTools.

Skills
Científico
4

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

Instale a skill (comando acima).
No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/workflow-generator && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__workflow-generator.md -o .claude/skills/workflow-generator/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

ENPT

#!/usr/bin/env python3
"""
deepTools Workflow Generator

Generates bash script templates for common deepTools workflows.
"""

import argparse
import sys


WORKFLOWS = {
    'chipseq_qc': {
        'name': 'ChIP-seq Quality Control',
        'description': 'Complete QC workflow for ChIP-seq experiments',
    },
    'chipseq_analysis': {
        'name': 'ChIP-seq Complete Analysis',
        'description': 'Full ChIP-seq analysis from BAM to heatmaps',
    },
    'rnaseq_coverage': {
        'name': 'RNA-seq Coverage Tracks',
        'description': 'Generate strand-specific RNA-seq coverage',
   

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