variant_files
O Pysam fornece a classe VariantFile para leitura e escrita de ficheiros VCF (Variant Call Format) e BCF (VCF binário). Estes ficheiros contêm informação sobre variantes genéticas, incluindo SNPs, indels e variantes estruturais.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/variant-files && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__variant-files.md -o .claude/skills/variant-files/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Working with Variant Files (VCF/BCF)
## Overview
Pysam provides the `VariantFile` class for reading and writing VCF (Variant Call Format) and BCF (binary VCF) files. These files contain information about genetic variants, including SNPs, indels, and structural variants.
## Opening Variant Files
```python
import pysam
# Reading VCF
vcf = pysam.VariantFile("example.vcf")
# Reading BCF (binary, compressed)
bcf = pysam.VariantFile("example.bcf")
# Reading compressed VCF
vcf_gz = pysam.VariantFile("example.vcf.gz")
# Writing
outvcf = pysam.VariantFile("output.vcf", "w", header=vcf.header)
- 🔒 Conteúdo completo no plano Pro (7,99€/mês) -Precisa de ajuda com o Claude Code?
Pergunte ao Dr AI - explica em simples.
Precisa de uma solução à medida?
Não sabe por onde começar a usar IA no seu negócio? Receba uma avaliação gratuita e um plano à medida - sem compromisso.
Poupe horas todas as semanas com IA, sem complicações
O Doutor AI dá-lhe 1859 prompts de IA prontos a copiar, por indústria e em português simples - mais uma biblioteca técnica completa para quem quer ir mais longe.