substructure_filter

Filtre moléculas com base em padrões de subestrutura utilizando SMARTS. Suporta filtros de inclusão e exclusão e bibliotecas de padrões personalizadas.

Skills
Científico
0

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

Instale a skill (comando acima).
No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/substructure-filter && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__substructure-filter.md -o .claude/skills/substructure-filter/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

ENPT

#!/usr/bin/env python3
"""
Substructure Filter

Filter molecules based on substructure patterns using SMARTS.
Supports inclusion and exclusion filters, and custom pattern libraries.

Usage:
    python substructure_filter.py molecules.smi --pattern "c1ccccc1" --output filtered.smi
    python substructure_filter.py database.sdf --exclude "C(=O)Cl" --filter-type functional-groups
"""

import argparse
import sys
from pathlib import Path

try:
    from rdkit import Chem
except ImportError:
    print("Error: RDKit not installed. Install with: conda install -c conda-forge rdkit")
    sys.exit(1)


# 

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