structure
O Bio.PDB fornece ferramentas para trabalhar com estruturas 3D macromoleculares de ficheiros PDB e mmCIF. O módulo utiliza a arquitetura SMCRA (Structure/Model/Chain/Residue/Atom) para representar estruturas de proteínas hierarquicamente.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/structure && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__structure.md -o .claude/skills/structure/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Structural Bioinformatics with Bio.PDB
## Overview
Bio.PDB provides tools for working with macromolecular 3D structures from PDB and mmCIF files. The module uses the SMCRA (Structure/Model/Chain/Residue/Atom) architecture to represent protein structures hierarchically.
## SMCRA Architecture
The Bio.PDB module organizes structures hierarchically:
```
Structure
└── Model (multiple models for NMR structures)
└── Chain (e.g., chain A, B, C)
└── Residue (amino acids, nucleotides, heteroatoms)
└── Atom (individual atoms)
```
## Parsing Structure Files
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