standard_workflow
Este documento descreve o fluxo de trabalho padrão para analisar dados de RNA-seq de célula única utilizando o scanpy.
- Skills
- Científico
- 5
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/standard-workflow && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__standard-workflow.md -o .claude/skills/standard-workflow/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Standard Scanpy Workflow for Single-Cell Analysis
This document outlines the standard workflow for analyzing single-cell RNA-seq data using scanpy.
## Complete Analysis Pipeline
### 1. Data Loading and Initial Setup
```python
import scanpy as sc
import pandas as pd
import numpy as np
# Configure scanpy settings
sc.settings.verbosity = 3 # verbosity: errors (0), warnings (1), info (2), hints (3)
sc.settings.set_figure_params(dpi=80, facecolor='white')
# Load data (various formats)
adata = sc.read_10x_mtx('path/to/data/') # For 10X data
# adata = sc.read_h5ad('path/to/data.h5ad') # Fo
- 🔒 Conteúdo completo no plano Pro (7,99€/mês) -Precisa de ajuda com o Claude Code?
Pergunte ao Dr AI - explica em simples.
Precisa de uma solução à medida?
Não sabe por onde começar a usar IA no seu negócio? Receba uma avaliação gratuita e um plano à medida - sem compromisso.
Poupe horas todas as semanas com IA, sem complicações
O Doutor AI dá-lhe 1859 prompts de IA prontos a copiar, por indústria e em português simples - mais uma biblioteca técnica completa para quem quer ir mais longe.