similarity_search
Realize a triagem de semelhança baseada em impressões digitais moleculares numa base de dados de moléculas. Suporta múltiplos tipos de impressões digitais e métricas de semelhança.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/similarity-search && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__similarity-search.md -o .claude/skills/similarity-search/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
#!/usr/bin/env python3
"""
Molecular Similarity Search
Perform fingerprint-based similarity screening against a database of molecules.
Supports multiple fingerprint types and similarity metrics.
Usage:
python similarity_search.py "CCO" database.smi --threshold 0.7
python similarity_search.py query.smi database.sdf --method morgan --output hits.csv
"""
import argparse
import sys
from pathlib import Path
try:
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import AllChem, MACCSkeys
from rdkit import DataStructs
except ImportError:
print("Error: RDKit not installed. Install wit
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