sequence_io
O Bio.Seq fornece o objeto Seq para sequências biológicas com métodos especializados, enquanto o Bio.SeqIO oferece uma interface unificada para ler, escrever e converter ficheiros de sequências em múltiplos formatos.
- Skills
- Científico
- 4
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/sequence-io && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__sequence-io.md -o .claude/skills/sequence-io/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Sequence Handling with Bio.Seq and Bio.SeqIO
## Overview
Bio.Seq provides the `Seq` object for biological sequences with specialized methods, while Bio.SeqIO offers a unified interface for reading, writing, and converting sequence files across multiple formats.
## The Seq Object
### Creating Sequences
```python
from Bio.Seq import Seq
# Create a basic sequence
my_seq = Seq("AGTACACTGGT")
# Sequences support string-like operations
print(len(my_seq)) # Length
print(my_seq[0:5]) # Slicing
```
### Core Sequence Operations
```python
# Complement and reverse complement
complement = my_s
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