region2vec
O Region2Vec gera embeddings não supervisionados de regiões genómicas e conjuntos de regiões a partir de ficheiros BED. Mapeia regiões genómicas para um vocabulário, cria frases através de concatenação e aplica o treino word2vec para aprend
- Skills
- Científico
- 3
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/region2vec && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__region2vec.md -o .claude/skills/region2vec/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Region2Vec: Genomic Region Embeddings
## Overview
Region2Vec generates unsupervised embeddings of genomic regions and region sets from BED files. It maps genomic regions to a vocabulary, creates sentences through concatenation, and applies word2vec training to learn meaningful representations.
## When to Use
Use Region2Vec when working with:
- BED file collections requiring dimensionality reduction
- Genomic region similarity analysis
- Downstream ML tasks requiring region feature vectors
- Comparative analysis across multiple genomic datasets
## Workflow
### Step 1: Prepare Data
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