QUALITY_METRICS
Guia abrangente para a avaliação de qualidade de unidades utilizando métricas do SpikeInterface e padrões Allen/IBL.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/quality-metrics && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__quality-metrics.md -o .claude/skills/quality-metrics/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Quality Metrics Reference
Comprehensive guide to unit quality assessment using SpikeInterface metrics and Allen/IBL standards.
## Overview
Quality metrics assess three aspects of sorted units:
| Category | Question | Key Metrics |
|----------|----------|-------------|
| **Contamination** (Type I) | Are spikes from multiple neurons? | ISI violations, SNR |
| **Completeness** (Type II) | Are we missing spikes? | Amplitude cutoff, presence ratio |
| **Stability** | Is the unit stable over time? | Drift metrics, amplitude CV |
## Computing Quality Metrics
```python
import spikeinterface.fu
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