proteomics_metabolomics_formats

Esta referência aborda formatos de ficheiro específicos para proteómica, metabolómica, lipidómica e fluxos de trabalho ómicos relacionados.

Skills
Científico
5

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

Instale a skill (comando acima).
No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/proteomics-metabolomics-formats && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__proteomics-metabolomics-formats.md -o .claude/skills/proteomics-metabolomics-formats/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

ENPT

# Proteomics and Metabolomics File Formats Reference

This reference covers file formats specific to proteomics, metabolomics, lipidomics, and related omics workflows.

## Mass Spectrometry-Based Proteomics

### .mzML - Mass Spectrometry Markup Language
**Description:** Standard XML format for MS data
**Typical Data:** MS1 and MS2 spectra, retention times, intensities
**Use Cases:** Proteomics, metabolomics pipelines
**Python Libraries:**
- `pymzml`: `pymzml.run.Reader('file.mzML')`
- `pyteomics.mzml`: `pyteomics.mzml.read('file.mzML')`
- `pyopenms`: OpenMS Python bindings
**EDA Approach:**
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