protein_analysis_workflow

Este script executa um pipeline completo de análise de proteínas: 1. Pesquisa no UniProt e obtenção de identificadores 2. Obtenção de sequências FASTA 3. Pesquisa de similaridade BLAST 4. Descoberta de vias KEGG 5. Mapeamento de interações

Skills
Científico
3

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

Instale a skill (comando acima).
No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/protein-analysis-workflow && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__protein-analysis-workflow.md -o .claude/skills/protein-analysis-workflow/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

ENPT

#!/usr/bin/env python3
"""
Complete Protein Analysis Workflow

This script performs a comprehensive protein analysis pipeline:
1. UniProt search and identifier retrieval
2. FASTA sequence retrieval
3. BLAST similarity search
4. KEGG pathway discovery
5. PSICQUIC interaction mapping
6. GO annotation retrieval

Usage:
    python protein_analysis_workflow.py PROTEIN_NAME EMAIL [--skip-blast]

Examples:
    python protein_analysis_workflow.py ZAP70_HUMAN user@example.com
    python protein_analysis_workflow.py P43403 user@example.com --skip-blast

Note: BLAST searches can take several minutes. Use

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