PREPROCESSING

Técnicas abrangentes de pré-processamento para registos neurais de Neuropixels.

Skills
Científico
3

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

Instale a skill (comando acima).
No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/preprocessing && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__preprocessing.md -o .claude/skills/preprocessing/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

ENPT

# Neuropixels Preprocessing Reference

Comprehensive preprocessing techniques for Neuropixels neural recordings.

## Standard Preprocessing Pipeline

```python
import spikeinterface.full as si

# Load raw data
recording = si.read_spikeglx('/path/to/data', stream_id='imec0.ap')

# 1. Phase shift correction (for Neuropixels 1.0)
rec = si.phase_shift(recording)

# 2. Bandpass filter for spike detection
rec = si.bandpass_filter(rec, freq_min=300, freq_max=6000)

# 3. Common median reference (removes correlated noise)
rec = si.common_reference(rec, reference='global', operator='median')

# 4. Remov

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