phylogenetics

O Bio.Phylo oferece um conjunto de ferramentas unificado para ler, escrever, analisar e visualizar árvores filogenéticas. Suporta múltiplos formatos de ficheiro, incluindo Newick, NEXUS, phyloXML, NeXML e CDAO.

Skills
Científico
3

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

Instale a skill (comando acima).
No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/phylogenetics && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__phylogenetics.md -o .claude/skills/phylogenetics/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

ENPT

# Phylogenetics with Bio.Phylo

## Overview

Bio.Phylo provides a unified toolkit for reading, writing, analyzing, and visualizing phylogenetic trees. It supports multiple file formats including Newick, NEXUS, phyloXML, NeXML, and CDAO.

## Supported File Formats

- **Newick** - Simple tree representation (most common)
- **NEXUS** - Extended format with additional data
- **phyloXML** - XML-based format with rich annotations
- **NeXML** - Modern XML format
- **CDAO** - Comparative Data Analysis Ontology

## Reading and Writing Trees

### Reading Trees

```python
from Bio import Phylo

# Read a 

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