metabolomics
O PyOpenMS oferece ferramentas especializadas para a análise de metabolómica não direcionada, incluindo a deteção de características otimizada para pequenas moléculas, agrupamento de adutos, identificação de compostos e integração com bases
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/metabolomics && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__metabolomics.md -o .claude/skills/metabolomics/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Metabolomics Workflows
## Overview
PyOpenMS provides specialized tools for untargeted metabolomics analysis including feature detection optimized for small molecules, adduct grouping, compound identification, and integration with metabolomics databases.
## Untargeted Metabolomics Pipeline
### Complete Workflow
```python
import pyopenms as ms
def metabolomics_pipeline(input_files, output_dir):
"""
Complete untargeted metabolomics workflow.
Args:
input_files: List of mzML file paths (one per sample)
output_dir: Directory for output files
"""
# Step 1
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