io_module
O módulo datamol.io fornece uma manipulação de ficheiros abrangente para dados moleculares em múltiplos formatos.
- Skills
- Científico
- 2
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/io-module && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__io-module.md -o .claude/skills/io-module/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Datamol I/O Module Reference
The `datamol.io` module provides comprehensive file handling for molecular data across multiple formats.
## Reading Molecular Files
### `dm.read_sdf(filename, sanitize=True, remove_hs=True, as_df=True, mol_column='mol', ...)`
Read Structure-Data File (SDF) format.
- **Parameters**:
- `filename`: Path to SDF file (supports local and remote paths via fsspec)
- `sanitize`: Apply sanitization to molecules
- `remove_hs`: Remove explicit hydrogens
- `as_df`: Return as DataFrame (True) or list of molecules (False)
- `mol_column`: Name of molecule column in
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