image_processing

Esta referência abrange o acesso a dados de píxeis brutos, a renderização de imagens e a criação de novas imagens no OMERO.

Skills
Científico
1

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

Instale a skill (comando acima).
No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/image-processing && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__image-processing.md -o .claude/skills/image-processing/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

ENPT

# Image Processing & Rendering

This reference covers accessing raw pixel data, image rendering, and creating new images in OMERO.

## Accessing Raw Pixel Data

### Get Single Plane

```python
# Get image
image = conn.getObject("Image", image_id)

# Get dimensions
size_z = image.getSizeZ()
size_c = image.getSizeC()
size_t = image.getSizeT()

# Get pixels object
pixels = image.getPrimaryPixels()

# Get single plane (returns NumPy array)
z, c, t = 0, 0, 0  # First Z-section, channel, and timepoint
plane = pixels.getPlane(z, c, t)

print(f"Shape: {plane.shape}")
print(f"Data type: {plane.dtype.na

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