geniml
Esta skill deve ser usada ao trabalhar com dados de intervalos genómicos (ficheiros BED) para tarefas de machine learning. Usar para o treino de embeddings de regiões (Region2Vec, BEDspace), análise de ATAC-seq de célula única (scEmbed),…
- Skills
- Científico
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Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/geniml && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__geniml.md -o .claude/skills/geniml/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
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name: geniml
description: This skill should be used when working with genomic interval data (BED files) for machine learning tasks. Use for training region embeddings (Region2Vec, BEDspace), single-cell ATAC-seq analysis (scEmbed), building consensus peaks (universes), or any ML-based analysis of genomic regions. Applies to BED file collections, scATAC-seq data, chromatin accessibility datasets, and region-based genomic feature learning.
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# Geniml: Genomic Interval Machine Learning
## Overview
Geniml is a Python package for building machine learning models on genomic interval data fr
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