filter_molecules
Este script fornece um fluxo de trabalho pronto para produção para filtrar bibliotecas de compostos utilizando regras de medchem, alertas estruturais e restrições personalizadas.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/filter-molecules && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__filter-molecules.md -o .claude/skills/filter-molecules/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
#!/usr/bin/env python3
"""
Batch molecular filtering using medchem library.
This script provides a production-ready workflow for filtering compound libraries
using medchem rules, structural alerts, and custom constraints.
Usage:
python filter_molecules.py input.csv --rules rule_of_five,rule_of_cns --alerts nibr --output filtered.csv
python filter_molecules.py input.sdf --rules rule_of_drug --lilly --complexity 400 --output results.csv
python filter_molecules.py smiles.txt --nibr --pains --n-jobs -1 --output clean.csv
"""
import argparse
import sys
from pathlib import Path
from t
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