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file_io

O PyOpenMS suporta múltiplos formatos de ficheiros de espetrometria de massa para leitura e escrita. Este guia abrange estratégias de manipulação de ficheiros e operações específicas de cada formato.

  • Skills
  • Científico
  • 0

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

  1. Instale a skill (comando acima).
  2. No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
  3. Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/file-io && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__file-io.md -o .claude/skills/file-io/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

Idioma do conteúdo
# File I/O and Data Formats

## Overview

PyOpenMS supports multiple mass spectrometry file formats for reading and writing. This guide covers file handling strategies and format-specific operations.

## Supported Formats

### Spectrum Data Formats

- **mzML**: Standard XML-based format for mass spectrometry data
- **mzXML**: Earlier XML-based format
- **mzData**: XML format (deprecated but supported)

### Identification Formats

- **idXML**: OpenMS native identification format
- **mzIdentML**: Standard XML format for identification data
- **pepXML**: X! Tandem format
- **protXML**: Protein id

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