file_io
O PyOpenMS suporta múltiplos formatos de ficheiros de espetrometria de massa para leitura e escrita. Este guia abrange estratégias de manipulação de ficheiros e operações específicas de cada formato.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/file-io && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__file-io.md -o .claude/skills/file-io/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# File I/O and Data Formats
## Overview
PyOpenMS supports multiple mass spectrometry file formats for reading and writing. This guide covers file handling strategies and format-specific operations.
## Supported Formats
### Spectrum Data Formats
- **mzML**: Standard XML-based format for mass spectrometry data
- **mzXML**: Earlier XML-based format
- **mzData**: XML format (deprecated but supported)
### Identification Formats
- **idXML**: OpenMS native identification format
- **mzIdentML**: Standard XML format for identification data
- **pepXML**: X! Tandem format
- **protXML**: Protein id
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