data_structures
O PyOpenMS utiliza objetos C++ com ligações em Python. Compreender estas estruturas de dados fundamentais é essencial para uma manipulação eficaz de dados.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/data-structures-2 && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__data-structures-2.md -o .claude/skills/data-structures-2/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Core Data Structures
## Overview
PyOpenMS uses C++ objects with Python bindings. Understanding these core data structures is essential for effective data manipulation.
## Spectrum and Experiment Objects
### MSExperiment
Container for complete LC-MS experiment data (spectra and chromatograms).
```python
import pyopenms as ms
# Create experiment
exp = ms.MSExperiment()
# Load from file
ms.MzMLFile().load("data.mzML", exp)
# Access properties
print(f"Number of spectra: {exp.getNrSpectra()}")
print(f"Number of chromatograms: {exp.getNrChromatograms()}")
# Get RT range
rts = [spec.getRT
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