coverage
O módulo uniwig gera faixas de cobertura a partir de dados de sequenciação, proporcionando uma conversão eficiente de intervalos genómicos para perfis de cobertura.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/coverage && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__coverage.md -o .claude/skills/coverage/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Coverage Analysis with Uniwig
The uniwig module generates coverage tracks from sequencing data, providing efficient conversion of genomic intervals to coverage profiles.
## Coverage Track Generation
Create coverage tracks from BED files:
```python
import gtars
# Generate coverage from BED file
coverage = gtars.uniwig.coverage_from_bed("fragments.bed")
# Generate coverage with specific resolution
coverage = gtars.uniwig.coverage_from_bed("fragments.bed", resolution=10)
# Generate strand-specific coverage
fwd_coverage = gtars.uniwig.coverage_from_bed("fragments.bed", strand="+")
rev_cov
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