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conformers_module

O módulo datamol.conformers fornece ferramentas para gerar e analisar conformações moleculares 3D.

  • Skills
  • Científico
  • 0

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

  1. Instale a skill (comando acima).
  2. No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
  3. Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/conformers-module && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__conformers-module.md -o .claude/skills/conformers-module/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

Idioma do conteúdo
# Datamol Conformers Module Reference

The `datamol.conformers` module provides tools for generating and analyzing 3D molecular conformations.

## Conformer Generation

### `dm.conformers.generate(mol, n_confs=None, rms_cutoff=None, minimize_energy=True, method='ETKDGv3', add_hs=True, ...)`
Generate 3D molecular conformers.
- **Parameters**:
  - `mol`: Input molecule
  - `n_confs`: Number of conformers to generate (auto-determined based on rotatable bonds if None)
  - `rms_cutoff`: RMS threshold in Ångströms for filtering similar conformers (removes duplicates)
  - `minimize_energy`: Apply UFF

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