blast

O Bio.Blast fornece ferramentas para executar pesquisas BLAST (tanto localmente como através de serviços web do NCBI) e analisar os resultados do BLAST em vários formatos. O módulo gere a complexidade de submeter consultas e analisar as saí

Skills
Científico
2

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

Instale a skill (comando acima).
No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/blast && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__blast.md -o .claude/skills/blast/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

ENPT

# BLAST Operations with Bio.Blast

## Overview

Bio.Blast provides tools for running BLAST searches (both locally and via NCBI web services) and parsing BLAST results in various formats. The module handles the complexity of submitting queries and parsing outputs.

## Running BLAST via NCBI Web Services

### Bio.Blast.NCBIWWW

The `qblast()` function submits sequences to NCBI's online BLAST service:

```python
from Bio.Blast import NCBIWWW
from Bio import SeqIO

# Read sequence from file
record = SeqIO.read("sequence.fasta", "fasta")

# Run BLAST search
result_handle = NCBIWWW.qblast(
    progr

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