bioinformatics_genomics_formats
Esta referência abrange formatos de ficheiros utilizados em genómica, transcriptómica, análise de sequências e aplicações relacionadas de bioinformática.
- Skills
- Científico
- 2
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/bioinformatics-genomics-formats && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__bioinformatics-genomics-formats.md -o .claude/skills/bioinformatics-genomics-formats/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# Bioinformatics and Genomics File Formats Reference
This reference covers file formats used in genomics, transcriptomics, sequence analysis, and related bioinformatics applications.
## Sequence Data Formats
### .fasta / .fa / .fna - FASTA Format
**Description:** Text-based format for nucleotide or protein sequences
**Typical Data:** DNA, RNA, or protein sequences with headers
**Use Cases:** Sequence storage, BLAST searches, alignments
**Python Libraries:**
- `Biopython`: `SeqIO.parse('file.fasta', 'fasta')`
- `pyfaidx`: Fast indexed FASTA access
- `screed`: Fast sequence parsing
**EDA Appr
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