bedspace
O BEDspace aplica o modelo StarSpace a dados genómicos, permitindo o treino simultâneo de embebimentos numéricos quer para conjuntos de regiões, quer para as respetivas etiquetas de metadados num espaço de baixa dimensão partilhado. Isto pe
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/bedspace && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__bedspace.md -o .claude/skills/bedspace/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
# BEDspace: Joint Region and Metadata Embeddings
## Overview
BEDspace applies the StarSpace model to genomic data, enabling simultaneous training of numerical embeddings for both region sets and their metadata labels in a shared low-dimensional space. This allows for rich queries across regions and metadata.
## When to Use
Use BEDspace when working with:
- Region sets with associated metadata (cell types, tissues, conditions)
- Search tasks requiring metadata-aware similarity
- Cross-modal queries (e.g., "find regions similar to label X")
- Joint analysis of genomic content and experimenta
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