batch_id_converter
Este script converte múltiplos identificadores entre bases de dados biológicas utilizando o serviço de mapeamento do UniProt. Suporta processamento em lote com divisão automática e tratamento de erros.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/batch-id-converter && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__batch-id-converter.md -o .claude/skills/batch-id-converter/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
#!/usr/bin/env python3
"""
Batch Identifier Converter
This script converts multiple identifiers between biological databases
using UniProt's mapping service. Supports batch processing with
automatic chunking and error handling.
Usage:
python batch_id_converter.py INPUT_FILE --from DB1 --to DB2 [options]
Examples:
python batch_id_converter.py uniprot_ids.txt --from UniProtKB_AC-ID --to KEGG
python batch_id_converter.py gene_ids.txt --from GeneID --to UniProtKB --output mapping.csv
python batch_id_converter.py ids.txt --from UniProtKB_AC-ID --to Ensembl --chunk-size 50
Input
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