batch_gene_lookup
Este script processa eficientemente múltiplas consultas de genes com limitação adequada de taxa de pedidos e tratamento de erros.
- Skills
- Científico
- 0
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/batch-gene-lookup && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__batch-gene-lookup.md -o .claude/skills/batch-gene-lookup/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
#!/usr/bin/env python3
"""
Batch gene lookup using NCBI APIs.
This script efficiently processes multiple gene queries with proper
rate limiting and error handling.
"""
import argparse
import json
import sys
import time
import urllib.parse
import urllib.request
from typing import Optional, List, Dict, Any
def read_gene_list(filepath: str) -> List[str]:
"""
Read gene identifiers from a file (one per line).
Args:
filepath: Path to file containing gene symbols or IDs
Returns:
List of gene identifiers
"""
try:
with open(filepath, 'r') as f:
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