analysis_template
Este template fornece um fluxo de trabalho completo para análise de RNA-seq de célula única utilizando o scanpy, desde o carregamento de dados até ao agrupamento e anotação do tipo de célula.
- Skills
- Científico
- 3
Para que serve e como usar
Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.
- Instale a skill (comando acima).
- No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
- Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.
Instalar (Claude Code)
mkdir -p .claude/skills/analysis-template && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__analysis-template.md -o .claude/skills/analysis-template/SKILL.mdCole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.
Conteúdo
#!/usr/bin/env python3
"""
Complete Single-Cell Analysis Template
This template provides a complete workflow for single-cell RNA-seq analysis
using scanpy, from data loading through clustering and cell type annotation.
Customize the parameters and sections as needed for your specific dataset.
"""
import scanpy as sc
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# ============================================================================
# CONFIGURATION
# ============================================================================
# File paths
INPUT_FILE = 'data/
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