alignment

O Bio.Align fornece ferramentas para alinhamento de sequências a par utilizando vários algoritmos, enquanto o Bio.AlignIO trata da leitura e escrita de ficheiros de alinhamento de sequências múltiplas em vários formatos.

Skills
Científico
1

Para que serve e como usar

Uma skill que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

Instale a skill (comando acima).
No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

Instalar (Claude Code)

mkdir -p .claude/skills/alignment && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__alignment.md -o .claude/skills/alignment/SKILL.md

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

Conteúdo

ENPT

# Sequence Alignments with Bio.Align and Bio.AlignIO

## Overview

Bio.Align provides tools for pairwise sequence alignment using various algorithms, while Bio.AlignIO handles reading and writing multiple sequence alignment files in various formats.

## Pairwise Alignment with Bio.Align

### The PairwiseAligner Class

The `PairwiseAligner` class performs pairwise sequence alignments using Needleman-Wunsch (global), Smith-Waterman (local), Gotoh (three-state), and Waterman-Smith-Beyer algorithms. The appropriate algorithm is automatically selected based on gap score parameters.

### Creating an

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