# basic_inference

> Se não forem fornecidos, todos os genes são considerados potenciais reguladores.

- Fonte: https://doutorai.pt/componentes/skills__basic-inference
- Tipo: Skills
- Categoria: Científico
- Downloads: 0
- Site: Doutor AI (https://doutorai.pt) - ferramentas de IA para pequenos negócios em português

Componente da comunidade open-source, selecionado, traduzido e adaptado pelo Doutor AI.

## Para que serve e como usar

Uma **skill** que ensina o Claude Code a executar bem tarefas de científico. É conhecimento empacotado que o modelo passa a usar sempre que for relevante.

1. Instale a skill (comando acima).
2. No Claude Code, descreva o que precisa - a skill ativa-se sozinha quando o contexto encaixa.
3. Não precisa de decorar comandos: fala em linguagem natural e a skill faz o resto.

## Instalar (Claude Code)

```bash
mkdir -p .claude/skills/basic-inference && curl -fsSL https://doutorai.pt/data/lib/skills__basic-inference.md -o .claude/skills/basic-inference/SKILL.md
```

Cole este comando no terminal, na pasta do seu projeto, e o componente é instalado automaticamente.

## Conteúdo

````
# Basic GRN Inference with Arboreto

## Input Data Requirements

Arboreto requires gene expression data in one of two formats:

### Pandas DataFrame (Recommended)
- **Rows**: Observations (cells, samples, conditions)
- **Columns**: Genes (with gene names as column headers)
- **Format**: Numeric expression values

Example:
```python
import pandas as pd

# Load expression matrix with genes as columns
expression_matrix = pd.read_csv('expression_data.tsv', sep='\t')
# Columns: ['gene1', 'gene2', 'gene3', ...]
# Rows: observation data
```

### NumPy Array
- **Shape**: (observations, genes)
- **Requ

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